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標題: tn5轉座酶作用原理 [打印本頁]

作者: 多喝熱水    時間: 2024-8-5 14:24
標題: tn5轉座酶作用原理
Tn5轉座酶(Tnp)序列全長477個氨基酸,包含三個主要結構域:N末端、催化結構域和C末端。N末端包含70個氨基酸,用于DNA結合;催化結構域位于中間,包含一個“核糖核酸酶H樣基序”和α/β/α折疊結構,負責轉座過程中的催化作用;C端則主要負責蛋白質-蛋白質相互作用。

作者: 芒果是只貓    時間: 2024-8-5 14:24
  Tn5轉座酶的作用機制主要遵循“剪切-粘貼”模式,具體過程如下:

  識別與結合:

  Tn5轉座酶首先識別并結合Tn5轉座子兩端的特定序列,即OE序列(Outside end sequence),該序列通常為19 bp長。

  兩個Tn5轉座酶分子識別并結合兩個OE序列后,通過C端的相互作用形成二聚體突觸復合物,該復合物具有切割DNA的能力。

  切割與轉移:

  在Mg^2+或其他金屬離子的介導下,Tn5轉座酶活化附近的水分子,對轉座子5’端的一條DNA鏈進行水解,形成3’-OH親核基團。

  3’-OH親核基團進一步攻擊互補鏈,形成發卡結構,并在另一活化水分子的作用下形成平端。

  轉座復合體隨后結合到受體DNA的大溝上,通過3’-OH親核基團對受體DNA雙鏈進行親核攻擊,完成鏈轉移過程。這一過程中,轉座子從供體DNA中完全切除,并插入到受體DNA的靶位點。
作者: 人淡如菊    時間: 2024-8-5 14:25
  Tn5轉座酶的應用:

  由于其轉座的隨機性好、穩定性高、插入位點容易測序等特點,Tn5轉座酶在分子生物學研究中具有廣泛應用,包括但不限于:

  一步法快速DNA建庫:在NGS文庫構建中,Tn5轉座酶可以在片段化DNA的同時將接頭序列加入到靶序列兩側,簡化實驗流程并降低樣本量需求。

  單細胞測序:利用Tn5轉座酶對單細胞DNA進行擴增和測序,研究單個細胞的基因表達和遺傳變異。

  表觀遺傳學研究:如ATAC-seq和CUT&Tag技術中,Tn5轉座酶用于研究染色質的開放程度和蛋白質-DNA互作關系。
作者: 四海    時間: 2024-9-3 18:46
樓上,真知灼見,受益良多,謝謝!




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